W ramach szczególnej ochrony przyrody nadleśnictwo Grotniki ochrania przyrodę kilkoma sposobami.

1. Na terenie nadleśnictwa utworzono 5 rezerwatów przyrody, obejmujących zachowane w stanie naturalnym lub mało zmienionym ekosystemy, określone gatunki roślin i zwierząt oraz elementy przyrody nieożywionej. Są to:
   • Rezerwat torfowiskowy "Torfowisko Rąbień"
   • Rezerwat przyrody "Dąbrowa Grotnicka"
   • Rezerwat przyrody "Grądy nad Lindą"
   • Rezerwat przyrody "Zabrzeźnia"
   • Rezerwat przyrody "Grądy nad Moszczenicą"
2. W granicach działania nadleśnictwa Grotniki utworzono park krajobrazowy - jest to obszar chroniony ze względu na wartości przyrodnicze, historyczne i kulturowe. W chwili obecnej powierzchnia Parku Krajobrazowego położona w granicach nadleśnictwa wynosi 13,49 ha.
   • Park Krajobrazowy Wzniesień Łódzkich

3. W zasięgu działania nadleśnictwa wyszukano, oznakowano i opisano 22 pomniki przyrody. W tym: 21 to pojedyncze piękne drzewa, a 1 pomnik to grupa drzew składająca się z 7 drzew. Gatunkowo pomnikami przyrody są:
   sosna zwyczajna - 1 szt.
   dąb szypułkowy - 15 szt.
   buk zwyczajny - 2 szt.
   lipa drobnolistna - 3 szt.
   grupa drzew - 6 szt. lipy drobnolistnej + 1 szt. dęba szypułkowego
4. W lasach nadleśnictwa Grotniki jest wiele miejsc mających znaczenie dla zachowania unikatowych zasobów genowych i typów środowisk, takich jak: naturalne zbiorniki wodne, środpolne i śródleśne "oczka wodne", kępy drzew i krzewów, bagna, torfowiska. Są to użytki ekologiczne. Nadleśnictwo posiada takowych obiektów przyrodniczych 27 o łącznej powierzchni 53,87 ha.